Н. Ф. Федоров был похоронен на кладбище Московского Скорбященского монастыря (в районе м. Новослободская). А. К. Горский в своей биографии мыслителя так описывал место его последнего упокоения: "Тело Николая Федоровича было предано погребению на кладбище Скорбященского женского монастыря, в настоящее время подвергшегося сильному разгрому и, как и все кладбища, находящиеся в пределах черты Камер-коллежского вала, предположенного к превращению в увеселительные сады и уже частично застроенного под рабочий городок. Там можно и сейчас разыскать его могилу в самом дальнем углу кладбища. Убогий, деревянный крест, сломанный в 1918–20 гг., в 1923 заменен черным чугунным. Накладное распятие сбито и сброшено. На дощечке помещены имя, отчество и фамилия, даты смерти и рождения (неправильно показан в качестве года рождения 1824). На перекладине креста сделана надпись: "Христос Воскрес" (А. Остромиров [А. К. Горский]. Николай Федорович Федоров. 1828–1903–1928. Биография, с. 20). Обновление креста, о котором здесь пишет Горский, было сделано по инициативе и на средства его самого и другого последователя идей Н. Ф. Федорова, философа Н. А. Сетницкого.

В архиве А. К. Горского и Н. А. Сетницкого сохранилась фотография могилы Федорова, сделанная, вероятно, после установки креста. На фотографии у могилы Сетницкий, Горский, В. Н. Миронович-Кузнецова, последовательница идей Н. Ф. Федорова в 1910–1920-е гг., и священник, вероятно, служивший панихиду на могиле.